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进化树怎么看同源性
在发育树中，同源性可以通过比较不同生物的基因、蛋白质和代谢产物等分子标记物来推断。通过比较这些分子标记物的相似性，可以确定生物在发育树的哪个分支上具有同源性，从而推断它们在发育过程中的共同特征。
这树有什么好分析的，只是做出来给别人看的，看一下跟那个模式菌株最接近。其实真正的同源性分析的话，就是你在数据库里做比对的时候，同源性最高的那个菌株有分析价值。其他的菌株都只是一个比较。
如果两个序列/物种 间的头部几乎在一个竖线上，就是同源性越高，如果很长，就说明很远.问题三：如何读懂进化树 进化树在生物学中，用来表示物种之间的进化关系。
观察物种的分支：系统发育树的分支表示物种的分化过程。基于共同的性状或遗传信息，他们被定为有亲缘关系的物种，相似的物种通常位于相同的分支上。
应用计算机分析两个主要阅读框ORF1和ORF2并推导其氨基酸序列，推测这些变异可能与PCV2抗原性及致病性的改变有关，并建立了遗传进化树。该进化树主要分为两大群.3％～100％，由于经常以亚临床感染的形式出现。
什么是动物进化树
1、进化树(evolutionary tree)又名系统树(phylogenetie tree)进化树，用来表示物种间亲缘关系远近的树状结构图。在进化树中，各个分类单元(物种)依据进化关系的远近，被安放在树状图表上的不同位置。
2、生物进化树给出分支层次或拓扑图形，它是产生新的基因复制或享有共同祖先的生物体的歧异点的一种反映，树枝的长度反映当这些事件发生时就存在的蛋白质之间的进化距离。
3、果树的历史自然比人类长，你所说的几种都是被子植物。
4、五界系统反映了生物进化的三个阶段和多细胞阶段的三个分支，是有纵有横的分类。它没有包括非细胞形态的病毒在内，也许是因为病毒系统地位不明之故。
5、哺乳动物和爬行动物怎么看进化树哺乳动物，首先它的幼崽是要吃奶的，绝大部分的哺乳动物都是胎生的。而爬行动物呢，它是生的，但是它没有乳汁。
进化树构建背景资料
1、值得注意的是，构建ML树，不需要事先的多序列比对，而直接使用FASTA格式的序列即可。贝叶斯的算法以MrBayes为代表，不过速度较慢。一般的进化树分析中较少应用。由于该方法需要很多背景的知识，这里不作介绍。
2、有时称此类方法构建的结构进化树为“类结构”进化树。
3、比如很难横向对比进化距离。因此，适用于展示差异较大的物种或基因样本。这种图用于根不确定的进化树构建。它可以将相似度高的样本序列聚集在一起。因此，更适合做亲缘关系近的物种或差异小的基因样本。
4、基于距离的方法：首先通过各个物种之间的比较，根据一定的假设（进化距离模型）推导得出分类群之间的进化距离，构建一个进化距离矩阵。进化树的构建则是基于这个矩阵中的进化距离关系。
